教祖の語る「元の理」は、１８５９年の西欧のチャールズ・ロバート・ダーウィン、アルフレッド・ラッセル・ウォレスの共著による「種の起源」が発表された２０年後の１８８０年頃において、この世や人間がいきなり創造されたのではなく、親神の意思に基づく宇宙の森羅万象の十の作用の共同と交合で、最初は水中に生息するごく小さな姿（五分）で生まれ、三度の出直し（生まれ替わり）を重ねて成長し、その後は様々な虫、鳥、獣畜類などへの「八千八度の生まれ変わり」を経て、その果てに一匹の｢めざる｣がこの世に生まれ、一腹に男五、女五の生命が産み出され、次に男一人女一人の二人ずつとなり、更に一腹に一人ずつ生まれるようになって今日の人間の姿になった。その進化に合わせてだんだんと世界も形作られた。陸に上がった人間は六千年間、智恵の仕込を受け、その後三千九百九十九年間、文字の仕込を受けるている云々の知見を披歴している。。

　世界から見れば片田舎の一老婆が、時代の最先端の科学的知見のダーウィン的進化論に通じる「種の生命の歩み」を当時の農民に唱えていたばかりか、「元の理」の諸内容は現代の科学的知見とも照合しており、今なお特段の齟齬が見当たらないことにある。